Le Fonds dispose de deux niveaux d’orientation, de décision et de financement :
- Le niveau national/intersectoriel qui vise le développement général des compétences et qualifications de la population malgache ;
- Le niveau sectoriel qui prend en compte les priorités stratégiques et opérationnelles des secteurs d’activité prioritaires du pays et vise à maintenir et développer les compétences des salariés travaillant dans les entreprises de ces secteurs.
Le niveau sectoriel est géré par 7 Comités Sectoriels Paritaires ou CSP couvrant :
- Les 5 secteurs prioritaires ayant participé à l’élaboration de la politique nationale d’emploi et de formation professionnelle :
- Textile/Habillement et Accessoires (THA),
- Tourisme / Hôtellerie / Restauration (THR),
- Technologies de l’Information et de la Communication (TIC),
- Bâtiment/Travaux Publics/Ressources Stratégiques (BTP/RS),
- Développement Rural (DR)
- Un champ multisectoriel regroupant les entreprises ne relevant pas de ces 5 secteurs ou ayant des activités transversales à ceux-ci – et notamment des activités émergentes comme par exemple la maintenance industrielle, l’économie bleue, les métiers environnementaux…
- Et, enfin, le secteur des micro, petites et très petites entreprises (MPE/TPE) qui emploient la très grande majorité d’une population active en forte demande d’éducation et de qualification. Les MPE/TPE sont en général non cotisantes et le financement des projets les concernant est donc essentiellement assuré par des ressources additionnelles externes.